西医针灸和中医针灸在理论、技术和应用上存在显著区别。西医针灸，也称为医学针灸或医疗针灸，是在现代医学框架下发展起来的一种治疗方法。它侧重于解剖学和神经学知识，针灸针对特定的解剖结构和生理机制进行操作，常用于疼痛管理、神经调节等方面。

而中医针灸则根植于中医理论，依据经络学说、气血理论等中医基础理论，认为人体的疾病是气血失调或经络阻塞所致。中医针灸注重“气”的调理，强调整体平衡和防病于未然。针灸的穴位和操作方式多依据中医经典著作，注重经络、气血的调理与平衡。

在实践应用上，西医针灸通常在临床医院或医疗机构由专业医生进行，结合了现代医学诊疗手段，常用于辅助治疗。而中医针灸除了在中医医院和诊所应用外，也常见于养生保健场所，强调个体的调理和身心的和谐。

西医针灸强调现代医学知识和临床实践，而中医针灸则侧重于中医理论和整体调理，两者在概念、方法和应用上有明显的区别。