男孩小便尿不干净，可能有多种原因，主要包括以下几个方面：

1. 生理原因：一些男孩的尿道口较小，导致尿液流出时受到阻碍，造成尿不干净。包皮过长或包茎也可能导致尿液无法顺畅排出，残留在包皮内。

2. 行为因素：一些男孩在排尿时缺乏耐心，匆忙结束排尿，导致尿液残留。还有一些男孩在排尿过程中分心，无法集中注意力，导致尿不干净。

3. 泌尿系统感染：尿道感染或膀胱炎等泌尿系统感染可能引起尿频、尿急和尿不尽等症状。感染会导致排尿时的不适感，男孩可能因此无法完全排空膀胱。

4. 神经系统问题：神经系统的发育不完善可能影响膀胱和尿道的控制功能，导致尿液残留。神经系统疾病或损伤也可能引发类似问题。

5. 心理因素：压力、焦虑等心理因素可能影响排尿功能。一些男孩在紧张或不安时可能无法顺畅排尿，导致尿不干净。

针对以上原因，家长可以采取以下措施：观察男孩的排尿情况，注意是否存在生理异常；培养良好的排尿习惯，鼓励男孩在排尿时集中注意力并耐心等待；如怀疑存在泌尿系统感染，应及时就医，进行专业检查和治疗。如果问题持续存在或严重，建议咨询儿科医生或泌尿科医生，进行详细的检查和诊断。