对于“南京哪家做包皮手术好”的问题，建议您在选择医疗机构时应该考虑以下几个方面：

1. 医院资质：选择有资质、拥有相关手术经验的医院，例如具备相关资质认证或拥有良好口碑的公立医院或知名私立医院。

2. 医生经验：选择有丰富手术经验、专业技术过硬的医生进行手术，建议咨询医生的资质、工作经历以及手术成功率等信息。

3. 设备和环境：确保手术所在的医疗环境卫生、手术设备先进，有助于手术的顺利进行和术后康复。

4. 术后服务：选择提供全面术后跟踪服务、术后指导和咨询的医院，有助于术后康复和问题解决。

在考虑以上因素的基础上，可以向医生咨询，或者参考相关医疗机构的官方网站、患者评价等信息，做出最佳的选择。